分纯专题

外泌体相关基因肝癌临床模型预测——2-3分纯生信文章复现——5.拷贝数变异及突变图谱(2)

内容如下: 1.外泌体和肝癌TCGA数据下载 2.数据格式整理 3.差异表达基因筛选 4.预后相关外泌体基因确定 5.拷贝数变异及突变图谱 6.外泌体基因功能注释 7.LASSO回归筛选外泌体预后模型 8.预后模型验证 9.预后模型鲁棒性分析 10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析 11.列线图,ROC曲线,校准曲线,DCA曲线 12.外部数据集验证 13.外泌

二区5分纯生信|单细胞+非负矩阵+AlphaFold+机器学习组合

说在前面 学文不看刊 这篇分析总体来说工作量不算大,scRNA联合bulkRNA分析,多种机器学习组合预测模型,最后用了AlphaFold2预测蛋白及AutoDock分子对接 非常适合小白学习和模仿,其次在筛选出核心基因后可以再加几个外部数据集观察表达表征,单细胞层次也可再次进行验证,堆上工作量 今天给大家分享的一篇文章:Unveiling the molecular complex

外泌体相关基因肝癌临床模型预测——2-3分纯生信文章复现——02.数据格式整理(1)

内容如下: 1.外泌体和肝癌TCGA数据下载 2.数据格式整理 3.差异表达基因筛选 4.预后相关外泌体基因确定 5.拷贝数变异及突变图谱 6.外泌体基因功能注释 7.LASSO回归筛选外泌体预后模型 8.预后模型验证 9.预后模型鲁棒性分析 10.独立预后因素分析及与临床的相关性分析 11.列线图,ROC曲线,校准曲线,DCA曲线 12.外部数据集验证 13