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超全拆解AlphaFold 3,上海交大钟博子韬:极致利用数据,以原子精度预测所有生物分子结构,但并不完美
能够以「原子精度」预测出所有生物分子结构和相互作用的 AlphaFold 3,一经面世便引起了业界的广泛讨论。8 月 13 日,在上海交通大学 AI for Bioengineering 暑期学校活动中,钟博子韬博士以「AlphaFold 3:原理,应用与展望」为题,系统性地梳理了他的学习心得,并广泛整理了来自科研界的众多相关研究成果,向大家分享了他对于 AlphaFold 3 的深刻洞察, Hy
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ViSNet:用于分子性质预测和动力学模拟的通用分子结构建模网络
编者按:尽管几何深度学习已经彻底颠覆了分子建模领域,但最先进的算法在实际应用中仍然面临着几何信息利用不足和高昂计算成本的阻碍。为此,微软研究院科学智能中心(Microsoft Research AI4Science)的研究员们提出了通用分子结构建模网络 ViSNet。在多个分子动力学基准测试中,ViSNet 均表现优异。 分子几何建模在理解生物活性机制、化学性质预测、药物设计和蛋白质工程方面
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RDKit:基于分子文件输出分子结构
#!/usr/bin/python3from rdkit import Chemfrom rdkit.Chem import Drawspl = Chem.SDMolSupplier('molecules.sdf') #读入分子库mols = []for mol in spl:mols.append(mol)# 获取前十个分子mols = mols[:10]#输出分子结构img =
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画一些低聚物的分子结构真的很难学吗?
感觉各种方式画都可以啊,比如 又比如, 以及,
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CrystalMaker 10.6.2 新完整版 晶体和分子结构软件
CrystalMaker是一款功能强大的晶体分子结构图绘制软件,其交互式设计让你看到分子的结构并建立你自己对复杂材料的视觉理解。CrystalMaker让你创建可旋转动画可视化,能量建模工具可让你设计和创建新结构,预测其振动特性,并探索它们与其他材料的连接方式,是非常好的理想的教学和科研软件。 通过该软件用户可以对需要的晶体、分析的结构进行创建,对可以进行旋转的动画进行创建,而且有动态可视化的支
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