vcftools专题

vcftools安装

下载安装VCFtools 下载地址:VCFtools    下载vcftools-vcftools-d511f46.tar.gz压缩包后 tar zxvf ./vcftools-vcftools-d511f46.tar.gzcd /mnt/workspace/wzf/Tools/vcftools-vcftools-d511f46bash autogen.sh./configurem

如何用vcftools从VCF文件中提取某条染色体信息

如何用vcftools从VCF文件中提取某条染色体信息 vcftools --gzvcf input.vcf --chr n --recode – recode-INFO-all --stdout | gzip -c > output.vcf.gz 说明: –gzvcf:处理压缩格式的vcf文件(可替换为–vcf) –chr n:选择染色体n,例:–chr 1 –recode:重新编码为vcf文