upset专题

放弃Venn-Upset-花瓣图,拥抱二分网络

写在前面 让点随机排布在一个区域,保证点之间不重叠,并且将点的图层放到最上层,保证节点最清晰,然后边可以进行透明化,更加突出节点的位置。这里我新构建了布局函数 PolyRdmNotdCirG 来做这个随机排布。调用的是packcircles包的算法。使用和其他相似函数一样,这里我们重点介绍一下使用这种算法构造的二分网络布局。 微生物网络 ggClusterNet 安装 ggClusterNe

笔记—R语言做upset交集图

#不适合样本数量太多 install.packages("UpSetR") library(UpSetR) library(dplyr) library(tidyr) library(ggplot2) library(plyr) library(gridExtra)  library(grid) require(ggplot2); require(plyr); require(gridExtr

R画Upset韦恩图

基于UpSetR画Upset韦恩图 首先data的格式为 setwd('D:\\16_huangjian\\02_DEG')library(ggplot2)library(readxl)library(UpSetR)matrix = read.table("./upsForplot.txt", header=T, row.names=NULL, sep="\t")nsets = dim