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GCenFF生成Gromacs Topol文件用于CHARMM36力场

这是自己初学Gromacs后,第一次自己用GCenFF生成Gromacs topol 文件。此文作为自己的学堂札记便于日后回访。同时分享给刚入门Gromacs分子动力学模拟的同学。 环境准备: Linux装有1. numpy; 2. networkx (1.11); Python 2.7.3 或Python 3.5.6 GCenFF生成topol文件整体流程如下: 1. 拿Gaussian