sctransform专题

SCTransform normalization seurat

完成了前面的基础质控、过滤以及去除细胞周期的影响后,我们可以开始SCTransform normalization。 SCTransform normalization的优势: 1️⃣ 一个SCTransform函数即可替代NormalizeData, ScaleData, FindVariableFeatures三个函数;2️⃣ 对测序深度的校正效果要好于log标准化(10万以内的细胞都建