scimc专题

scIMC:scRNA-seq插补方法基准

在scRNA-seq中一个主要的挑战即为“dropout”事件,它扭曲了基因表达,显著影响了单细胞转录组的下游分析。为了解决这个问题,已经做了很多努力,并开发了几种基于模型和基于深度学习的scRNA-seq插补方法。但是,目前还缺乏对现有方法进行全面、系统的比较。在这项工作中,作者使用6个模拟和2个真实的scRNA-seq数据集,从以下四个方面全面评估和比较了总共12种可用的插补方法:1.基因表达