rmats专题

rmats应该使用哪一个gtf呢

安装好ramts后,在丝滑运行可变剪切代码时,还需要下载一个用于gene annotation的文件。以genecode中的鼠鼠为例,那么多gtf,应该用哪一个呢? 经过鸭鸭考证原作者github给出的例子,推荐使用第三个content为comprehensive gene annotation, regions是pri的,description包含chromosome和scaffold