read10x专题

【单细胞转录组】使用Seurat的Read10X函数读取10x文件时为什么有格式要求

非模式物种在分析时可能会遇到各种各样的问题,但是也能学习到一些不太会注意到的小细节。比如我在分析数据的时候,使用seurat查找差异基因后绘图,这里展示一下某个cluster的结果: 可以注意到出来Os号外还有一些看起来奇奇怪怪的基因,我本来以为是注释文件的问题。经师姐提醒,我去检查了一下features.tsv这个文件中的信息,发现这些长得奇奇怪怪的基因确实是存在的,而且是在第二列 也可