最近在qiime2论坛发现有人发布了qiime2宏基因组的教程，这里分享一下，只是alpha版本，不成熟，大家谨慎了解。qiime2的专用格式对于折腾宏基因组还是有点不妥的，个人观点，但是好在他能让分析标准化，可追溯的话，我觉得还是利大于弊的。 地址在这：宏基因组学与QIIME 2 - 2024年春季莱顿和苏黎世教程 - 宏基因组分析与QIIME2 警告 使用 QIIME 2 进行的宏基因组学分

最近看到生信技能树的一篇推文在介绍nf-core这个流程管理工具，发现官方有qiime2的流程，学习一下，顺便探索一下中间的坑。关于nf-core，这篇推文已经介绍的够多了，我这里主要学习它的搭建和使用。 一、环境搭建 首先，先进行环境搭建工作，这是必修课和基础，没有环境，什么也做不了。理解下来，nf-core可以使用三种方式进行环境准备，本地安装，conda或者docker，一般来说，对新手