实际进行生信分析时，更需要的是series类型的数据，和Java 将PubMed GEO DataSets中dataset类型的检索结果转化为Excel中的方法一样，首先转成TXT，然后借助jxl包转为Excel。 源代码如下： /** To change this license header, choose License Headers in Project Properties.*

检索结果举例 为进行生信分析，需要对检索结果转化为Excel并且以标签作为列。首先将检索结果Send to File转化成TXT格式，如下： 通过下面的程序进一步转为Excel(使用jxl包)： 源代码： /** To change this license header, choose License Headers in Project Properties.* To change t

本文主要是自己的在线代码笔记。在生物医学本体Ontology构建过程中，我使用Selenium定向爬取生物医学PubMed数据库的内容。         PubMed是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要。它的数据库来源为MEDLINE（生物医学数据库），其核心主题为医学，但亦包括其他与医学相关的领域，像是护理学或者其他健康学科。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的支援，

PubMed数据采集，转化为python中的DataFrame格式，并存放到MySQL数据库 1 PubMed数据采集2 数据加载到python中并进行DataFrame类型转化3 将DataFrame数据存放到MySQL数据库4 将MySQL数据库中的表格读取到python中 手动反爬虫： 原博地址 https://blog.csdn.net/lys_828/article/de