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gromacs + plumed 编译安装教程

简介 gromacs的基本编译安装教程请参考:gromacs 编译安装教程。 本文介绍如何结合plumed安装gromacs。 编译plumed PLUMED 是分子系统中自由能计算的开源库,与一些最流行的分子动力学引擎一起工作。 可以使用诸如元动力学,伞形采样和基于 Jarzynski 方程的转向 MD 之类的现有技术来执行自由能计算作为许多次序参数的函数,特别关注生物学问题。 官网地