pacbio专题

PacBio-组装介绍

主页:github: PacificBiosciences/FALCON 转自:https://www.cnblogs.com/leezx/p/5724590.html 简介 Falcon是一组通过快速比对长reads,从而来consensus和组装的工具。 Falcon工具包是一组简单的代码集合,我使用它们来研究单倍体和二倍体基因组的高效组装算法。 为了提高计算速度,它有一些后台代

PacBio的异构体测序(Iso-Seq)

在真核生物中,大多数基因可以编码多个蛋白质,这是因为基因经过可变剪接,可产生多个转录异构体,从而大大增加了基因组的蛋白编码潜力。来自同一个基因的可变剪接异构体可能有着明显不同、甚至拮抗的作用。为了研究基因表达,研究人员利用新一代测序方法研究了生物体各个基因的片段,这种方法通常称为RNA测序(RNA-seq)。短读长RNA-seq的原理是将转录本异构体打断成较小的片段,然后利用生物信息学工具将其重

结合Illumina和PacBio SMRT测序技术对复杂植物基因组组装方法的探究

结合Illumina和PacBio SMRT测序技术对复杂植物基因组组装方法的探究 文献类型:学位论文  作者王筱学位类别硕士答辩日期2015-04授予单位中国科学院研究生院授予地点北京导师王文关键词复杂基因组 基因组组装 Illumina Hiseq测序 PacBio测序 实时单分子 铁皮石斛其他题名The exploration of complex plant genome assemb