namd专题

龙讯旷腾PWmat发PRL:多k点计算的NAMD方法应用于小型超胞与在等效的大型超胞中进行的单个Γ点模拟之间的一致性

文章信息 作者信息:郑帆,汪林望 通信单位:上海科技大学 中国科学院半导体所 背景导读 固态材料中的超快载流子动力学在能源材料、光电子学、传感器和量子材料等领域起着关键作用。随着超快实验技术在固态系统中载流子动力学研究中的快速发展,对相关现象的微观理解,特别是第一原理计算,变得非常重要。非绝热分子动力学(NAMD)提供了一个有效手段,可以很好地模拟电荷热化、界面载流子转移、激子转移

NAMD 分子动力学模拟在生物及材料计算中的应用-新手村

一:分子动力学相关软件及 Linux 入门 目标:了解 NAMD 软件,掌握NAMD 安装环境,了解 Linux 语言 1 NAMD 下载与安装 2 NAMD 模拟所需文件简介(结构文件,配置文件,参数文件等) 3 相关 Linux 语言基础 二:VMD 可视化软件的安装和使用 4 VMD 安装和使用 4.1VMD 基础 4.2 多分子处理和脚本 4.3 载入轨迹并用简单的脚本计算以泛素为例 三:

NAMD和VMD在Windows下的安装(分子动力学模拟)

一、VMD在Windows下的安装 1.进入VMD官网 https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/ 2.选择 Software-VMD-Download。  3.选择对应的版本(这里用到的是 Windows 64-bit)。  4.注册(Username)和密码(Password),点击“Continue with registrat