mutmap专题

Mutmap定位拟南芥的基因

mutmap 定位基因也是基于BSA的方法,之前一篇博客 BSA分析拟南芥F2代分离群体混池测序 是做的突变体也野生型杂交后代中F2选择极端个体,加亲本进行测序分析的一篇流程。上篇中的数据也可以用mutmap 分析,仅仅才用野生型亲本测序的数据,和后代突变类型混池的数据即可。方法和上边的类似,也是计算每个SNP等位基因的频率。只不过这里另一个极端混池用亲本表示了,因为极端个体的标记和基因型都是趋于