GATK 的 Mutect2 是一个用于检测体细胞变异（somatic mutations）的工具，主要用于癌症研究。体细胞变异是指在个体发育过程中体细胞中发生的 DNA 变化，这些变异不遗传给下一代，但在癌症发展过程中起到重要作用。Mutect2 是 GATK 工具集的一部分，专门设计用于识别这些变异。 Mutect2功能与用途 主要功能包括： 体细胞突变检测：Mutect2 可以检测癌

建立分析目录 #拷贝数据到分析目录 cp /mnt/h/data/nuodaodataRENCEL/zuoborequest/*fq.gz ./ #质量检测 ls *fq.gz | xargs fastqc -t 20 -o fastqc_row/ multiqc fastqc_row/ #制作含有样本名称的文本  ls *_1.fq.gz >1  ls *_2.fq.gz >2 paste