kraken2专题

宏基因组学中基于Kraken2、Blast、ViPhOG和VirSorter等工具分析病毒组的详细流程,包括数据预处理、病毒序列检测、分类和功能注释等步骤

宏基因组学中分析病毒组的详细流程,包括数据预处理、病毒序列检测、分类和功能注释等步骤。 示例代码使用了常用的生物信息学工具,如Kraken2、Blast、ViPhOG和VirSorter等。 1. 数据预处理 质量控制: 使用FastQC进行原始测序数据的质量检查,然后使用Trimmomatic或Cutadapt去除低质量 reads 和接头。 步骤: 使用FastQC进行质量