kgml专题

KEGGgraph : 根据kgml 文件从pathway中重构出基因互作网络

KEGGgraph 包可以解析kgml 文件,从中得到不同对象之间的网络结构,并在此基础上进一步挖掘其中的信息。 KEGGgraph 包提供了以下3种基本功能: 将kgml 文件转换为基因互作网络 用法示例 # 读取hsa00020xml 文件> mapkG <- parseKGML2Graph("hsa00020.xml",expandGenes=TRUE, genesOnly = TRUE