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RNA-seq分析(Fastqc+Trimmomatic+STAR+HTseq-count+DESeq2)
最近做RNA-seq,正好把流程整理下,也希望分享和相互学习。 具体将以Fastqc + Trimmomatic + STAR + HTseq-count + DEseq2的流程来进行。 查看数据完整性 for dir in `ls`; do cd $dir; md5sum -c MD5_*txt; cd ..; done 预处理 FastQC + Trimmomatic fas
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