genehapr专题

使用geneHapR进行基因单倍型分析(以vcf文件为例)

前记        在群体基因组学研究中,我们常常需要知道一些位点的变异情况,以便于根据对应的表型信息估算这些位点的效应,同时了解这些位点在不同亚群之间的变化情况。这个时候我们就需要进行单倍型分析(Haplotype Analysis),单倍型分析是研究基因组中特定区域的单倍型状态的方法,通过确定个体的单倍型组合及其频率,了解基因座间的关联性以及对特定性状影响。        geneHapR