ete3专题

使用Python ete3包快速大批量地寻找物种的NCBI Taxonomy分类的完整信息(物种名和Taxid可进行相互转换)

ete全称为Environment for Tree Exploration,直译就是树探索环境,此工具可以直接在终端输入 pip install ete3 进行安装即可。ete包主要功能与构建系统发生树有关,若是有相关需求可以查看其介绍文档,地址:The ETE tutorial。我主要使用到了其中的分类工具,即处理NCBI 的Taxonomy数据库的工具。此工具用于物种信息和分类号的转换十分简