dotplot专题

「JCVI教程」如何基于物种的CDS的blast结果绘制点图(dotplot)

这是唐海宝老师GitHub上的JCVI工具的非官方说明书。 该工具集的功能非常多,但是教程资料目前看起来并不多,因此为了能让更多人用上那么好用的工具,我就一边探索,一边写教程 这一篇文章教大家如何利用JCVI里面的工具绘制点图,展现两个物种之间的共线性关系。 在分析之前,你需要从PhytozomeV11 下载A.thaliana和Alyrata的CDS序列,保证文件夹里有如下内容 Al