dongfeng专题

rnaseq_dongfeng_overlapABC_heatmap

提要: 本次实验给了我三个样品ABC,其中A是单端测序仅有一个文件,B,C为双端测序,有两个文件。给我的数据都是clean data,因此我没有进行质控,直接从STAR比对开始,然后利用了rsem进行转录本定量。利用DEseq2进行差异表达分析。其中分组为B相对与A上调的基因为upAB,B相对于C上调的基因为upBC。分别找到两组上调基因后去overlap共同的基因,然后将这些overlap到的基