cystocape专题

生物信息学入门 富集分析与蛋白质互作用网络(PPI)的可视化 Cystocape入门指南

网络图是生物信息学中常用的显示不同节点之间关联方向与关联程度的可视化方法。在富集分析中,网络图常被用于表示功能与估计到该功能的基因的联系。在蛋白质互作用网络中,网络图常用于表示编码基因之间的互作用类型与作用强度,基于这些信息,还可以通过某一节点与其他节点的连接数量来判断该节点在整个网络中的贡献度(degree)。绘制网络图常使用cystoscape软件,通过输入符合规范的数据,调整合适的参数,