CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA， 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊； CIRI 根据3种模型来识别circRNA， 连接点处的read 叫做junction read A)   circRNA 由3个外显子环化形成， 由于测序读长的限制，junction read 只覆盖了起始外显子和终止外显子的部分序列，这两部分reads的比对位置在基因组

欢迎关注”生信修炼手册”! 在最初的环状RNA研究中，认为环状RNA都是由exon通过反向剪切构成的,称之为exonic circRNA，只有这样的环状RNA能够由PCR反应验证出来的。 CIRI是一款环状RNA检测软件，通过该软件的预测结果，学者第一次用实验验证出了intronic circRNA和intergenic circRNA。该软件操作简便，准确度高，是非常流行的一款环状RNA检测软