CIRI 根据circRNA 连接点处的reads来识别circRNA， 在连接点处的reads 其比对情况非常特殊； CIRI 根据3种模型来识别circRNA， 连接点处的read 叫做junction read A)   circRNA 由3个外显子环化形成， 由于测序读长的限制，junction read 只覆盖了起始外显子和终止外显子的部分序列，这两部分reads的比对位置在基因组