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busco,checkM2,checkM:基因组或MAG完整度分析
busco安装(应该是一般用于真核生物) mamba create -n BUSCO biopython=1.79conda activate BUSCOmamba install -c bioconda python=3.8 sepp=4.3.10mamba install -c bioconda busco=5.7.1busco 使用 #下载数据库(2024-01-08)bu
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Busco-真核生物为主基因组质量评估
文章目录 简介Install必须参数谱系数据集输出结果自动谱系选择结果解读完整片段化缺失 自动选择:多domain和污染匹配注意BUSCO报告常用脚本真核Ref 简介 Busco评估基因组质量的核心原理在于通过计算基因组的通用单拷贝标记基因的比例来估计基因组的完整性。其中两个重要概念,高通用标记基因(High university)以及低重复比例(Low duplicabilit
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