利用 Vesta 软件绘制团簇构型 ICO多面体(二)

2024-01-10 10:28

本文主要是介绍利用 Vesta 软件绘制团簇构型 ICO多面体(二),希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

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进入网站下载 ICO 文件:

http://www.pas.rochester.edu/~wangyt/algorithms/bop/

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利用 Vesta 软件进行绘制。

这个网址是关于键序参数分析的一个程序,感兴趣的可以看一下,官网里有详细的介绍。

文章题目:Melting of icosahedral gold nanoclusters from molecular dynamics simulations

文章链接:http://dx.doi.org/10.1063/1.1917756

Program title: Bond Order Parameters (bop)

软件网址: 

http://www.pas.rochester.edu/~wangyt/algorithms/bop/

键序参数法(Bond-orientational Order Parameter,BOP)是通过分析原子构型的对称性来识别不同构型的原子。为了确定体系的最终构型,采用基于球谐函数的键序参数Ql来区分固体构型和液体构型,其范围是从0到1。为了进一步考察晶体熔化前后的微观结构,BOP是Steinhardt等提出研究熔化的常用分析手段,也被用来表征全局原子结构和长程结晶顺序。通过计算平均键合取向序参量Qlm,可以方便地得到第二阶Ql和第三阶Wl的旋转不变量。

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