本文主要是介绍Ala-Pro-Ala-βNA,201985-58-2,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!
编号: 202241
中文名称: 三肽Ala-Pro-Ala-βNA
CAS号: 201985-58-2
单字母: H2N-APA-βNA
三字母: H2N-Ala-Pro-Ala-βNA
氨基酸个数: 3
分子式: C21H26N4O3
平均分子量: 382.46
精确分子量: 382.2
等电点(PI): -
pH=7.0时的净电荷数: 0.97
平均亲水性: -0.5
疏水性值: 0.67
外观与性状: 粉末状固体
消光系数: -
来源: 人工化学合成,仅限科学研究使用,不得用于人体。
储存条件: 负80℃至负20℃
多肽H2N-Ala-Pro-Ala-βNA的合成步骤:
1、合成CTC树脂:称取0.85g CTC Resin(如初始取代度约为0.4mmol/g)和0.41mmol Fmoc-Ala-OH于反应器中,加入适量DCM溶解氨基酸(需要注意,此时CTC树脂体积会增大好几倍,避免DCM溶液过少),再加入1.02mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反应2-3小时后,可不抽滤溶液,直接加入1ml的HPLC级甲醇,封端半小时。依次用DMF洗涤2次,甲醇洗涤1次,DCM洗涤一次,甲醇洗涤一次,DCM洗涤一次,DMF洗涤2次(这里使用甲醇和DCM交替洗涤,是为了更好地去除其他溶质,有利于后续反应)。得到 Fmoc-Ala-CTC Resin。结构图如下:
2、脱Fmoc:加3倍树脂体积的20%Pip/DMF溶液,鼓氮气30分钟,然后2倍树脂体积的DMF 洗涤5次。得到 H2N-Ala-CTC Resin 。(此步骤脱除Fmoc基团,茚三酮检测为蓝色,Pip为哌啶)。结构图如下:
3、缩合:取1.02mmol Fmoc-Pro-OH 氨基酸,加入到上述树脂里,加适当DMF溶解氨基酸,再依次加入2.04mmol DIPEA,0.97mmol HBTU。反应30分钟后,取小样洗涤,茚三酮检测为无色。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂。(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。得到Fmoc-Pro-Ala-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:树脂=3:6:2.85:1(摩尔比)。结构图如下:
4、依次循环步骤二、步骤三,依次得到
H2N-Pro-Ala-CTC Resin
Fmoc-Ala-Pro-Ala-CTC Resin
以上中间结构,均可在专肽生物多肽计算器-多肽结构计算器中,一键画出。
最后再经过步骤二得到 H2N-Ala-Pro-Ala-CTC Resin,结构如下:
5、N端临时Boc保护:加适当DMF到树脂中,再依次加入4.08mmol DIPEA,2.04mmol Boc酸酐溶液,鼓氮气反应30分钟。取小样茚三酮检测为无色。Boc酸酐:DIPEA:树脂=6:12:1(摩尔比)。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到 Boc-Ala-Pro-Ala-CTC Resin。结构如下:
6、全保护切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液体积约为树脂体积的3倍。再次用DCM洗涤树脂2遍(去除残留DMF),后将配置好的溶液倒入到反应器中,反应30分钟。抽滤树脂,收集滤液(此时多肽已经从树脂上分离,存在于滤液中)。多肽序列为 Boc-Ala-Pro-Ala-CTC Resin。 在滤液中添加DIEPA,调PH至7-8。用饱和NaHCO3洗涤滤液,分离出DCM层溶液。可适当旋蒸DCM层溶液,减少有机溶剂。再次加入1或2倍体积的乙酸乙酯,用稀HCl溶液调PH至微酸性,将多肽从DCM层萃取到乙酸乙酯层。用饱和NaCl洗涤2次乙酸乙酯层。用无水硫酸镁吸收乙酸乙酯层的水分。通过减压旋蒸,直接将乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶体状固体多肽,用于下一步C端反应。或通过减压旋蒸保留适量乙酸乙酯的溶液体积,加入冰乙醚析出 多肽,然后对多肽进行烘干操作即可用于下一步C端反应。Boc-Ala-Pro-Ala-COOH的结构图如下。
7、2-萘胺反应连接:在上述树脂中,加入适当DMF后,再加入1.02mmol 2-萘胺到树脂中,再加入2.04mmol DIPEA、0.97mmol HBTU,鼓氮气反应30分钟。用2倍树脂体积的DMF 洗涤3次树脂(洗涤树脂,去掉残留溶剂,为下一步反应做准备)。 得到 Boc-Ala-Pro-Ala-βNA。 结构如下:
8、切割:6倍树脂体积的切割液(或每1g树脂加8ml左右的切割液),摇床摇晃 2小时,过滤掉树脂,用冰无水乙醚沉淀滤液,并用冰无水乙醚洗涤沉淀物3次,最后将沉淀物放真空干燥釜中,常温干燥24小试,得到粗品H2N-Ala-Pro-Ala-βNA。结构图见产品结构图。
切割液选择:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前两种适合没有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三种适合几乎所有的序列。)
9、纯化冻干:使用液相色谱纯化,收集目标峰液体,进行冻干,获得蓬松的粉末状固体多肽。不过这时要取小样复测下纯度 是否目标纯度。
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