使用pydicom读取dicom文件,并对文件做一些简单操作

2024-08-27 20:08

本文主要是介绍使用pydicom读取dicom文件,并对文件做一些简单操作,希望对大家解决编程问题提供一定的参考价值,需要的开发者们随着小编来一起学习吧!

#! /usr/bin/python
# -*- coding: utf-8 -*-
import dicom
import pylab
ds=dicom.read_file("/home/s/data/LungCancer/CT/benign/contrast/602825/a_0161.dcm")##查看有哪些属性
print ds.dir("pat")##查看对应属性的具体值
print ds.PatientName##将属性值给某个元素。。。具体什么意思还不懂。
data_element = ds.data_element("PatientsName")  # or data_element = ds[0x10,0x10]
print data_element.VR, data_element.value##删除属性
#del ds.SoftwareVersions##原始二进制文件
pixel_bytes = ds.PixelData##CT值组成了一个矩阵
pix = ds.pixel_array##读取显示图片
pylab.imshow(ds.pixel_array, cmap=pylab.cm.bone)
pylab.show()##修改图片中的元素,不能直接使用data_array,需要转换成PixelData
for n,val in enumerate(ds.pixel_array.flat): # example: zero anything < 300if val < 300:ds.pixel_array.flat[n]=0
ds.PixelData = ds.pixel_array.tostring()
ds.save_as("/home/s/data/LungCancer/mycodetest/newfilename.dcm")

参考: http://pydicom.readthedocs.io/en/latest/working_with_pixel_data.html

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http://www.chinasem.cn/article/1112657

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