ampliseq专题

使用nf-core的ampliseq(qiime2)流程分析16S数据

最近看到生信技能树的一篇推文在介绍nf-core这个流程管理工具,发现官方有qiime2的流程,学习一下,顺便探索一下中间的坑。关于nf-core,这篇推文已经介绍的够多了,我这里主要学习它的搭建和使用。 一、环境搭建 首先,先进行环境搭建工作,这是必修课和基础,没有环境,什么也做不了。理解下来,nf-core可以使用三种方式进行环境准备,本地安装,conda或者docker,一般来说,对新手